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VMWareの仮想マシンで一時的にディスク領域を沢山使うと、ディスクイメージのファイルが膨らんだままになってしまいます。 そういう場合は仮想マシンの方で

vmware-toolbox-cmd disk shrink /

とやると無駄な領域を削除してくれます。 ゲストがWindowsの場合は、VMwareToolboxCmd.exeです。

VMWareToolsが入っている必要があります。